Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpusd3Q14AI6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rpusd3Q14AI6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpusd3Q14AI6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rpusd3Q14AI6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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