Protein–RNA interactions for Protein: Q149R9

Lpar5, Lysophosphatidic acid receptor 5, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpar5Q149R9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Lpar5Q149R9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpar5Q149R9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lpar5Q149R9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lpar5Q149R9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpar5Q149R9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Lpar5Q149R9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lpar5Q149R9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Lpar5Q149R9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpar5Q149R9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms