Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf3ip1Q149C2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf3ip1Q149C2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf3ip1Q149C2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms