Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gli2Q0VGT2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gli2Q0VGT2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli2Q0VGT2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms