Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spata18Q0P557 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata18Q0P557 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata18Q0P557 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms