Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc7a1Q09143 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc7a1Q09143 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms