Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CluQ06890 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CluQ06890 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CluQ06890 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CluQ06890 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CluQ06890 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CluQ06890 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms