Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atf4Q06507 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms