Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sox12Q04890 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sox12Q04890 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms