Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcr5Q04683 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms