Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CkbQ04447 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CkbQ04447 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CkbQ04447 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CkbQ04447 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms