Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfiaQ02780 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NfiaQ02780 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms