Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RykQ01887 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RykQ01887 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RykQ01887 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RykQ01887 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RykQ01887 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RykQ01887 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RykQ01887 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RykQ01887 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RykQ01887 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms