Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd1Q01822 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd1Q01822 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms