Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrcdQ00LT2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrcdQ00LT2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms