Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp1Q00915 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp1Q00915 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms