Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PgrQ00175 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PgrQ00175 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PgrQ00175 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms