Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra1P97785 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra1P97785 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms