Protein–RNA interactions for Protein: P97494

Gclc, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclcP97494 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GclcP97494 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GclcP97494 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GclcP97494 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GclcP97494 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GclcP97494 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GclcP97494 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GclcP97494 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GclcP97494 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GclcP97494 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GclcP97494 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GclcP97494 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GclcP97494 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GclcP97494 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GclcP97494 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GclcP97494 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GclcP97494 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GclcP97494 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GclcP97494 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GclcP97494 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GclcP97494 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GclcP97494 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GclcP97494 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms