Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SlbpP97440 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SlbpP97440 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlbpP97440 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlbpP97440 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SlbpP97440 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlbpP97440 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms