Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frg1P97376 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frg1P97376 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms