Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irx3P81067 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irx3P81067 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms