Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx2P81066 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx2P81066 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx2P81066 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms