Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms