Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema3eP70275 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema3eP70275 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema3eP70275 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms