Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DccP70211 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DccP70211 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DccP70211 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DccP70211 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DccP70211 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DccP70211 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DccP70211 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DccP70211 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DccP70211 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DccP70211 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DccP70211 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DccP70211 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DccP70211 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DccP70211 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DccP70211 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DccP70211 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DccP70211 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DccP70211 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DccP70211 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DccP70211 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DccP70211 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
DccP70211 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DccP70211 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DccP70211 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DccP70211 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DccP70211 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DccP70211 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DccP70211 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DccP70211 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms