Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp3P63024 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms