Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx1P63013 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms