Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23aP62751 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23aP62751 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms