Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl18aP62717 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms