Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lmo4P61969 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lmo4P61969 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lmo4P61969 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lmo4P61969 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmo4P61969 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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