Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Copz1P61924 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms