Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Depdc5P61460 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Depdc5P61460 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Depdc5P61460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms