Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2kP61087 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2kP61087 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms