Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgnP59242 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CgnP59242 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CgnP59242 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CgnP59242 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CgnP59242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CgnP59242 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgnP59242 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CgnP59242 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgnP59242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgnP59242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CgnP59242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgnP59242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgnP59242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgnP59242 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgnP59242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms