Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Csrnp3P59055 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms