Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctdsp1P58466 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdsp1P58466 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms