Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd38P56528 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms