Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defb1P56386 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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