Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab8aP55258 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab8aP55258 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms