Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CebpaP53566 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CebpaP53566 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms