Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfP51642 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfP51642 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfP51642 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfP51642 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfP51642 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CntfP51642 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CntfP51642 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CntfP51642 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CntfP51642 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfP51642 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfP51642 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms