Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cav1P49817 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms