Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtpreP49446 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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