Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atoh1P48985 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms