Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prox1P48437 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prox1P48437 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prox1P48437 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms