Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd1P48410 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd1P48410 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms