Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edn3P48299 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms