Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx2P48031 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx2P48031 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms