Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax7P47239 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax7P47239 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax7P47239 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms